Documentation du Dr FRAPPE

Ce wiki regroupe les résultats de mes expériences en informatique accumulés au cours de mes recherches sur le net.

Dans la mesure du possible, j'ai cité mes sources ; il en manque certainement… :-)

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Les deux révisions précédentesRévision précédente
Prochaine révision		Révision précédente
logiciel:internet:openclinica:start [2022/02/13 14:38] – adminlogiciel:internet:openclinica:start [2022/08/13 21:57] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
Ligne 17: Ligne 17:
 <WRAP center round important 60%> <WRAP center round important 60%>
 Dans tout ce qui suit, remplacez **v** ou **v.x.y** par la version Dans tout ce qui suit, remplacez **v** ou **v.x.y** par la version
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 installez le paquet **[[apt>openjdk-v-jdk]]** installez le paquet **[[apt>openjdk-v-jdk]]**
Ligne 37: Ligne 37:
 Vous pouvez vérifier par : Vous pouvez vérifier par :
   * <code>ll /usr/local</code>   * <code>ll /usr/local</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 <WRAP center round box 60%> <WRAP center round box 60%>
Ligne 60: Ligne 60:
   * <code>sudo mv jdk1* /usr/local/   * <code>sudo mv jdk1* /usr/local/
 sudo ln -s /usr/local/jdk1* /usr/local/java</code> sudo ln -s /usr/local/jdk1* /usr/local/java</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 Java est maintenant installé au bon endroit. Java est maintenant installé au bon endroit.
Ligne 80: Ligne 80:
   * <code>sudo mkdir /usr/local/tomcat/oldwebapps   * <code>sudo mkdir /usr/local/tomcat/oldwebapps
 sudo mv /usr/local/tomcat/webapps/* /usr/local/tomcat/oldwebapps</code> sudo mv /usr/local/tomcat/webapps/* /usr/local/tomcat/oldwebapps</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 ==== Installez la base de données PostgreSQL et de l'interface web PhpPgAdmin ==== ==== Installez la base de données PostgreSQL et de l'interface web PhpPgAdmin ====
Ligne 95: Ligne 95:
   * systèmes d'exploitation 32 bits :<code>wget http://svn.akazaresearch.com/oc/software/OpenClinica-3.1/linux/postgresql-8.4.1-1-linux.bin</code>   * systèmes d'exploitation 32 bits :<code>wget http://svn.akazaresearch.com/oc/software/OpenClinica-3.1/linux/postgresql-8.4.1-1-linux.bin</code>
   * systèmes d'exploitation 64 bits :<code>wget http://svn.akazaresearch.com/oc/software/OpenClinica-3.1/linux/postgresql-8.4.1-1-linux-x64.bin</code>   * systèmes d'exploitation 64 bits :<code>wget http://svn.akazaresearch.com/oc/software/OpenClinica-3.1/linux/postgresql-8.4.1-1-linux-x64.bin</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 ===== Installation (Linux) ===== ===== Installation (Linux) =====
Ligne 114: Ligne 114:
   * **i386** ou **i686** -> 32 bits   * **i386** ou **i686** -> 32 bits
   * **x86_64** -> 64 bits.   * **x86_64** -> 64 bits.
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 Créez un répertoire de travail sur un disque (**/media/...** ou **/home/user** ... Nous l'appellerons **/[DISQUE]** et faites-en le répertoire courant en exécutant les commandes suivantes : Créez un répertoire de travail sur un disque (**/media/...** ou **/home/user** ... Nous l'appellerons **/[DISQUE]** et faites-en le répertoire courant en exécutant les commandes suivantes :
Ligne 126: Ligne 126:
 <WRAP center round tip 60%> <WRAP center round tip 60%>
 Pour télécharger OpenClinica, vous devez avoir un [[https://community.openclinica.com/user/register|compte utilisateur de la communauté OpenClinica]] (inscription gratuite) et vous connecter à ce compte. Pour télécharger OpenClinica, vous devez avoir un [[https://community.openclinica.com/user/register|compte utilisateur de la communauté OpenClinica]] (inscription gratuite) et vous connecter à ce compte.
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 Après avoir téléchargé OpenClinica, déplacez-le vers le répertoire où vous avez téléchargé les autres composants logiciels (**/[DISQUE]/oc/install**): Après avoir téléchargé OpenClinica, déplacez-le vers le répertoire où vous avez téléchargé les autres composants logiciels (**/[DISQUE]/oc/install**):
Ligne 317: Ligne 317:
   * <code>alter user clinica with password 'XXXXXXXXX';   * <code>alter user clinica with password 'XXXXXXXXX';
 \q</code> \q</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 ==== Déploiement d'OpenClinica dans Tomcat ==== ==== Déploiement d'OpenClinica dans Tomcat ====
Ligne 343: Ligne 343:
 <WRAP center round tip 60%> <WRAP center round tip 60%>
 Essais FNF : [[logiciel:internet:openclinica:ocfnf]] Essais FNF : [[logiciel:internet:openclinica:ocfnf]]
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 ---- ----
Ligne 379: Ligne 379:
   * le retirer de /etc/init.d   * le retirer de /etc/init.d
   * <code>sudo update-rc.d tomcat remove</code>   * <code>sudo update-rc.d tomcat remove</code>
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 Pour arrêter et démarrer Tomcat manuellement : Pour arrêter et démarrer Tomcat manuellement :
Ligne 397: Ligne 397:
 <WRAP center round tip 60%> <WRAP center round tip 60%>
 Notez qu'il faut au minimum 1280 Mo de RAM avec ces paramètres. La quantité de mémoire disponible peut être déterminée à l'aide de la commande <code>free-m</code> qui donne la mémoire en Mo. Notez qu'il faut au minimum 1280 Mo de RAM avec ces paramètres. La quantité de mémoire disponible peut être déterminée à l'aide de la commande <code>free-m</code> qui donne la mémoire en Mo.
-</subnumberlist>+</WRAP>
  
 La valeur de MaxPermSize dépend du nombre de fichiers war que vous déployez. Le fichier war web nécessite PermGen=180m ; le war ws nécessite PermGen=90m. La valeur de MaxPermSize dépend du nombre de fichiers war que vous déployez. Le fichier war web nécessite PermGen=180m ; le war ws nécessite PermGen=90m.

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